يقوم الأئمة المرشدون والمرشدات المتخرجون من معهد محمد السادس لتكوين الأئمة المرشدين والمرشدات بمهام محددة في إطار الثوابت المذهبية والوطنية ومراعاة البيئة المؤسساتية والعالمية، وفي هذا الصدد يجب التمييز بين المهام الخاصة بالأئمة والمهام المشتركة بين الأئمة المرشدين والمرشدات:
المهام الخاصة بالأئمة خريجي معهد محمد السادس لتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات
تتألف المهام الخاصة بالأئمة بعد التخرج من برنامج تكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات مما يلي:
- إمامة الصلوات الخمس اليومية وصلاة الجمعة.
- المساهمـة فـي الارتـقاء بخطـب الجمـعة.
- تنظيم قراءة الحـزب الراتـب في المسجـد.
- رفـع الآذان أثناء غياب المـؤذن الرسمـي.
المهام المشتركة بين الأئمة المرشدين والمرشدات خريجي معهد محمد السادس لتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات
توجد مجموعة من المهام مشتركة بين الأئمة والمرشدين والمرشدات معهد محمد السادس لتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات هي التالية:
- إعطاء دروس في مختلف العلوم الإسلامية.
- إلقاء دروس الوعظ والإرشاد قصد تبليغ أحكام الشريعة الإسلامية.
- المساهمة في التكوين المستمر للأئمة وباقي القيمين الدينيين.
- المساهمة في الحفاظ على الوحدة الدينية للمجتمع وتماسكه ضمن ثوابت الأمة.
- تعليـم القـرآن الكـريم.
- إعطاء دروس في محو الأمية.
- المساهمة في النشاط الثقافي والاجتماعي بالمسجـد.
- إصلاح ذات البين عندما يطلب منهم ذلك.
- الإشراف على جميع الأنشطة الدينية أو التربوية أو الثقافية المنظمة بالمسجد.
- الحفاظ على النظام في المسجد وحمايته من كل نشاط خارج الإطار الديني.