تستغرق مدة التكوين الأساسي للطلبة المغاربة بمعهد محمد السادس لتكوين الأئمة والمرشدين والمرشدات، في كل دورة؛ اثني عشر شهرا، تتوزع على فصلين دراسيين، يستغرق كل واحد منهما ستة أشهر، يتلقى خلالهما المترشحون والمترشحات تكوينا مكثفا ومتينا في كل ما يتعلق بالتأهيل الشرعي والاجتماعي والثقافي اللازم، وتدريبهم على اكتساب مهارات الوعظ والإرشاد وفنون الخطابة وتقنيات التواصل.
أما الطلب، الأجانب فيستغرق تكوينهم مدة أطول، إذ تمتد مدة تكوين الطلبة القادمين من البلدان الإفريقية إلى سنتين، بينما يستغرق تكوين الطلبة القادمين من فرنسا إلى ثلاث سنوات، بحيث تخصّص السنة الثالثة لتلقّي دروس مكثفة في اللغة العربية، حتى يكون الخريج متمكنا منها.